Este edificio se construyó en la década de los años 20 (siglo XX) y fue diseñado para albergar el "Hostal Fávila". Fue sin embargo, Seminario Menor, y actualmente es la sede de la Escolanía además de museo de Covadonga.
El Museo tiene un precio de dos euros por adulto y 1 euro los menores. En el museo se recoge una muestra de los cambios y modificaciones que en el transcurrir del tiempo se han dado en el Santuario, desde la legendaria batalla hasta nuestros días.
En la colección que atesora se encuentran objetos, fotografías, pinturas, entre las cuáles, cabe destacar la corona de la Virgen y el Niño, realizada por el orfebre que fundó los Talleres de Arte Granda, Don Félix Granda Buylla.
Se estructura en diez apartados que se comentarán a continuación:
Trata de resumir los orígenes de la cueva, donde en el siglo VIII se veneraba una imagen de la virgen, además narra la batalla contra el Islam que afianzó la monarquía cristiana astur.
La constante afluencia de peregrinos y devotos, hizo que a partir del siglo XVII el Santuario experimentase un desarrollo al que colaboraron numerosas cofradías y congregaciones. La congregación de Madrid editará numerosas estampas que dan a conocer la imagen de la virgen y los parajes de Covadonga. El incendio de 1777 destruyó el antiguo templo de madera. El arquitecto Ventura Rodríguez, con el auspicio de Carlos III proyectó un nuevo templo que nunca llegó a construirse.
La emigración asturiana hacia América llevó consigo a la Santina cuyo culto se extendió y constituyó uno de los lazos de unión entre la comunidad emigrante. Las guerras de 1868 y 1898 hicieron que este culto se avivara en Cuba como símbolo de patriotismo español.
A mediados del siglo XIX Covadonga ya era uno de los santuarios con mayor afluencia de público de toda España. La visita de la reina Isabel II en 1868 y la de Alfonso XII en 1877 más la labor de los Obispos de la Diócesis sumados a los esfuerzos del Cabildo propiciarán el nuevo rumbo en el Santuario.
La ofrenda de exvotos a la Santina se documenta desde el siglo XVIII, y constituye una de las manifestaciones de devoción popular más curiosas.
Este apartado se encuentra directamente relacionado con el cuarto, suministrando los datos sobre el impulsor de la Basílica, el Obispo Sanz y Forés, el obispado de Martínez Vigil, la consagración de la basílica en 1901 y los distintos proyectos y arquitectos que intervinieron en su construcción.
Se estudia la repercusión del turismo en el Santuario de Covadonga, así como las transformaciones del entorno, la creación del Parque Nacional, etc.
Primer santo asturiano, perteneciente a la orden de los dominicos, fue obispo de Tricomia y sus restos se veneran en la Catedral de Oviedo. Murió en Indochina en 1858 y fue elevado a santo en 1988.
Fue beatificado en 1993 y canonizado el 4 de mayo de 2003. Se le atribuye la jaculatoria "Madre mía de Covadonga, salvadme y salvad a España".
Dedicado a la visita que Juan Pablo II realizó en agosto de 1989, primera visita de un papa a Covadonga. También se exponen documentos de la visita del papa Juan XXIII cuando aún era Cardenal Patriarca de Venecia.